嘉靖和朱载坖的要求是，南直隶运送粮食的事情务必要秘密进行，若是走漏消息，则以失泄军机之罪论处。这可把唐顺之等人难住了。
这不可是一封奏疏，这么好保密，这么多的粮食，船只还有押解的士卒，要想完全保密，何其困难。首先就是粮食的调集，这么多的粮食，一旦官府出面采买，不但会导致粮价立刻上涨，而且恐怕就会走漏消息。
谭纶道：“制军、总戎，不如先将苏州、松江两府今年的起运通过海运北送，这样的话也便于保密。”
其实大家都很清楚，嘉靖要的保密也就是第一次的保密，船只到达津和辽东之前，绝对不能走漏消息。一旦粮食抵达，保密也就不存在此事了。而在整个粮食的运输过程中，最容易走漏消息的就是筹集粮食的环节了，大批粮食的买卖、调运，都很容易引起关注。
而现在的官府，要想完全保密是很困难的，所以谭纶建议，先直接转运本该通过运河转阅苏松两府漕粮，这些粮食已经在苏松两府的库房之中了，对于官府来，调动这些粮食是比较容易的，也不容易引起外间的怀疑，而且这两府也在唐顺之和谭纶的直接控制之下，便于调运。
但是这些粮食可是有专门用途的，是需要转运京师的漕粮，虽然唐顺之、谭纶贵为督抚大员，但是也不能轻易调动这些粮食。若是没有过得去的理由，就算是唐顺之、谭纶也不能让地方州县的长官交出这些粮食，这可是关系到他们考成的。
唐顺之思虑了一会，道：“之前户部有令，查收三十六年以前通州寄库余银及改折挂欠漕粮济边，嘉靖三十六年新运暂徵折色三分之一，每石银七钱。其南京仓粮，量于原折数外每石加银一钱，不若以此为词，有督抚衙门缴纳折色，令州县将本色运出。”
戚继光也道：“制军、都宪，若是这粮食能够运出，就以发放军士粮饷为由，直接解入营中起运即可。”
这样显然是目前最可行的方案了，唐顺之随即签发牌票，令苏松二府将今年本色直接交戚继光部充军粮，所欠折色由总督、巡抚衙门支付，既然有督抚大员担保，苏松两府的官员们也就随即将调拨粮食送到戚继光指定的地点，戚继光也开始拣选士卒，调拨船只等。
第一次试行海运，戚继光肯定是要亲自押阅，免得出什么纰漏。戚继光也查阅了之前洪武、永乐时的路线，自松江府出海，途径淮安府云梯关、鹰游山等浅海海域，自竹岛向东北经靖海卫、宁津所转至成山卫、威海卫、登州府，至 此进入渤海湾海域，自候镇西北大、清河海口、乞沟河入直沽，抵津卫，计三千三百一十里。
戚继光准备按照永乐时的路线行进，毕竟是已经经过实践的，嘉靖三十六年七月初十日，南直隶总兵官戚继光亲自统帅水师护卫沙船，自松江府金山卫南汇千户所出发，押运漕粮二十万石，去往津。
而京师内外，已经是日渐紧张了，首先是黄台吉、俺答从大同右卫撤围之后，就杳无踪迹，这使得大明朝廷的神经始终紧绷着，因为朝廷内外都很清楚，俺答绝不会就此罢休的，他们原本图谋大同右卫，但是被官军挫败，没有抢掠到财物，肯定会卷土重来的，就是不知俺答的目标是何处。
虽然九边官军极力打探北虏的动向，但是到现在为止都没有什么消息，一不能确定俺答的动向，大明君臣的心就放不下来。
更加要命的是由于整个北方今年受灾，嘉靖不得不大规模蠲免北方的税粮，使得北方各省缴纳的税粮大幅度减少，而需要赈济的地方却在不断增加，现在是漕粮还未抵达京师，而请求赈济的奏疏已经如同雪片一般飞往京师，请求朝廷赈济。
但是眼下的通州仓，据严世蕃仔细查点之后，仅剩存粮六百九十万石，要想赈济受灾地区，实在是有心无力。而北直隶已经出现了大批的流民，他们纷纷涌向京师，进一步推高了京师的粮价，现在京师的粮价已经超过二两一石了，而漕粮还在运往淮安府等待起阅路上，最少还需要一个月才能抵达京师。
而比京师更加要命的是辽东的情况，据辽东镇巡抚恭顺侯吴继爵奏报：辽东斗米至价银八钱，民饥死者十八九。议赈议蠲，别无良策。乞速发粮食，否则不特生民无着，官军亦无粮饷也！
辽东形势危急，嘉靖也很清楚，一旦军储耗尽，士卒就会作乱，大明的这些丘八爷可不是什么善类，一旦没有粮饷，闹饷哗变都是寻常事。现在北虏的踪迹尚不清楚，辽东镇要是再出事情，那可就麻烦了，所以嘉靖当即直接下令户部，先速发军粮二十万石与辽东，安抚军心，千万不能导致哗变。
而聚集在京师附近的流民也越来越多，这也是使得嘉靖极为忧虑的事情，为此嘉靖召集阁臣和六部重臣商议此事。
嘉靖问道：“眼下京师附近流民日多，诸卿计将安出？”
徐阶道：“陛下，眼下首先要做的是赈济灾民，令北直隶各府州县正官遍历乡村，集甲里老，举善食以司粥厂。就便多立厂所，每厂收养饥民二百。不拘土着、流移，分别老幼妇女给粥，不致生乱。”
眼下大批流民聚集京师，首先要做的就是安抚民心，免生事端，否则这么多流民，要是真的作乱，那可就麻烦了，对于这点，嘉靖也是深知厉害的，不但令通州仓出粮赈济，还下令动员京师的富户、寺院、道观等协助官府赈济百姓。
同时也要准备安置这些流民，他们身无长物，即便是回到故里，恐怕也难以生存，朝廷必须想办法安顿他们，嘉靖难得的出内帑五万两，安置流民，派太医购买药材，防止瘟疫，对于怎么处置流民，朝廷已经有成熟的处理办法了。
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