亚马逊雨林的晨雾中，南美队押解着琴酒踏上返程之路。特制囚车的车厢内，琴酒被双重束缚带固定在座椅上，黑色风衣上还残留着河水的湿痕，他低垂着头，发丝遮住了眼底的狠厉，只有指尖偶尔的抽搐，暴露了内心的不甘。赤井秀一坐在副驾驶座上，视线始终通过后视镜锁定琴酒，通讯器里不断传来沿途警方的清场通报：“前方五十公里路段已完成警戒，无组织残余势力活动痕迹。”
押解车队抵达巴西玛瑙斯机场时，国际刑警的专机已等候在专用停机坪。队员们心翼翼地将琴酒押上飞机，机舱内布满了防爆装置与实时监控设备，两名狙击手分别占据机舱两侧的观察位，形成无死角防控。安室透检查完机舱安全部署，通过加密通讯器向米花市情报中心汇报：“押解专机已准备就绪，将直飞东京，全程开启最高级别加密通讯，每十五分钟同步一次位置。”
米花市情报中心内，沈慕正通过卫星实时追踪专机轨迹，屏幕上的安全防护圈将专机牢牢包裹。柯南趴在桌前，整理着从雅诺马米部落带回的基因筛选记录，一旁的灰原哀则专注解析着琴酒随身携带的加密通讯器：“已破解通讯器内的部分数据，发现琴酒与组织潜伏在南美政界的成员有过联络，这些人曾为组织提供基因基地的庇护。”沈慕立刻将相关信息同步给国际刑警，启动跨国协查程序。
专机飞行途中，首次远程审讯同步展开。沈慕通过视频连线直面琴酒，屏幕上的琴酒抬眼扫视，嘴角勾起一抹冷笑：“你们以为抓了我，就能彻底摧毁组织？”系统“核心成员心理侧写”功能实时运行，提示“琴酒极度自负，且对组织有强烈的归属感，可从‘组织存在的意义’切入突破心理防线”。沈慕随即拿出乌丸莲耶的审讯记录：“乌丸莲耶已全盘招供，‘永生计划’不过是他的妄想，你不过是他实现野心的棋子。”
琴酒的眼神瞬间变得锐利，呼吸略显急促。安室透趁热打铁，将组织隐秘兵工厂被捣毁的画面推到镜头前：“你的武器补给已彻底断绝，残余势力要么被捕要么溃散，组织已经名存实亡。”这句话彻底击溃了琴酒的心理防线，他猛地攥紧拳头，指节发白：“乌丸那个老东西！我为组织出生入死，他居然率先招供！”情绪失控间，琴酒脱口而出组织在全球隐藏的最后一批资金账户与潜伏据点。
沈慕立刻让技术团队核实琴酒供述的信息，系统“资金网络溯源”功能全速运行，很快锁定了分布在欧洲、非洲的五个隐秘账户，账户内仍有近百亿美金的资金。“这些账户的实际控制人是组织的财务核心成员，目前仍在逃。”沈慕立刻将账户信息同步给国际刑警，“请求协助冻结账户，并排查相关成员的行踪。”
与此同时，第三卷成果落地工作在全球范围内有序推进。南美警方根据琴酒的供述，在巴西里约热内卢抓获了组织潜伏在政界的三名核心成员，彻底切断了组织在南美的政治庇护；欧洲刑警在法国巴黎捣毁了组织最后的潜伏据点，抓获外围成员12名，缴获大量加密文件；医疗团队则带着灰原哀研发的解药试用品，前往各地为被组织药物侵害的受害者提供治疗。
少年侦探团的孩子们在阿笠博士家，通过新闻看到琴酒落网的消息，兴奋地欢呼起来。元太捧着一大碗咖喱饭，大声道：“以后再也不用担心坏确乱了！”光彦拿出笔记本，认真记录着这场跨越全球的追缉战：“这是沈慕哥哥和柯南的伟大胜利！”柯南看着孩子们纯真的笑容，心中满是释然，这正是他一直以来守护的美好。
押解专机顺利抵达东京羽田机场，琴酒被严密押解下飞机，送上前往警视厅特殊监狱的囚车。沿途街道上，不少民众自发前来围观，挥舞着“正义必胜”的标语，掌声与欢呼声此起彼伏。警视厅内，针对琴酒的正式审讯已准备就绪，技术人员将全程记录审讯过程，确保所有供词都能作为司法审判的关键证据。
FbI安全屋内，多方势力代表齐聚一堂，召开第三卷总结暨协作机制延续会议。大屏幕上，第三卷的核心成果清晰呈现：捣毁组织核心据点4处、全球潜伏及备用据点32处，抓获核心成员17名（含乌丸莲耶、琴酒、朗姆等）、外围成员213名，冻结资金470亿美金，解救受害者86名，彻底瓦解了组织的全球犯罪网络。
“第三卷的胜利，离不开各方的紧密协作。”沈慕站在屏幕前，语气沉稳，“从最初的线索追踪，到跨国联合行动，再到最终的核心成员抓捕，FbI、公安、国际刑警形成了高效的协同体系。这一体系需要延续下去，应对未来可能出现的跨国有组织犯罪。”赤井秀一补充道：“FbI已整理出完整的行动手册，可作为后续跨国协作的参考模板。”
安室透拿出公安的协作规划：“建议建立跨国犯罪情报共享平台，由各方派遣专人常驻，实时同步线索。同时，定期开展联合训练，强化战术配合。”柯南趴在桌前，补充道：“还有那些被组织胁迫的科研人员，我们需要为他们提供保护，帮助他们回归正常生活，部分有价值的科研成果，也可以合理利用起来造福社会。”
会议最后，各方明确邻四卷的核心方向：彻底肃清组织残余的零散势力，追缴所有隐藏资金；推进全球范围内的司法审判，让所有组织成员都受到法律的制裁；完善跨国协作机制，防范新的犯罪势力崛起；协助所有受害者恢复正常生活，重建家园。
傍晚时分，全球范围内的组织残余势力肃清工作全部完成，国际刑警传来最终通报：“组织的所有已知势力已被彻底瓦解，未发现任何遗漏的据点或成员。”沈慕将第三卷的所有资料整理归档，最后一份卷宗的封面印着“第三卷：终章——正义昭彰，黑网尽破”。
夕阳西下，金色的余晖洒满米花町。沈慕、柯南、赤井秀一、安室透站在FbI安全屋的楼顶，望着下方宁静的城剩通讯器里传来各方队员的祝福消息，所有人都在为这场胜利欢呼。“第三卷结束了，但我们的责任还没结束。”沈慕看着远方，语气坚定，“未来，我们将继续守护这份安宁。”
夜幕缓缓降临，米花町的灯光次第亮起，温暖而祥和。第三卷的帷幕在正义的光辉中正式落下，这场跨越全球的追缉之战，最终以邪恶的覆灭、正义的胜利画上圆满句点。而属于他们的全新征程，也将在这份安宁与默契中，缓缓开启。
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